PacBio高通量基因测序仪 PacBio RS II System 资产编号201535127 规格/型号*/*PacBio RS II 产地中国 性能指标1.测序读长:平均读长 3-12 Kb,最长可达30Kb; 2.一致性准确率:一致性准确率可达 99.99%; 3.极端GC含量检测能力:无需PCR扩增,适合极端GC含量基因组; 4.碱基修饰
PacBio高通量基因测序仪

PacBio高通量基因测序仪

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PacBio高通量基因测序仪

PacBio RS II System


资产编号201535127
规格/型号*/*PacBio RS II
产地中国
性能指标1.测序读长:平均读长 3-12 Kb,最长可达30Kb; 2.一致性准确率:一致性准确率可达 99.99%; 3.极端GC含量检测能力:无需PCR扩增,适合极端GC含量基因组; 4.碱基修饰:可直接读取,并可以检测未知碱基修饰及DNA损伤类型; 5.有效数据产量/Cell:0.5-1.2G/Cell; 6.输出数据格式和数据兼容性:数据格式和二代兼容; 7.软件:smrt analysis提供二级数据分析。
主要应用1.未知物种全基因组从头测序; 2.已测序物种的基因组重新测序; 3.特定目标区域深度测序; 4.微生物多样性分析(全长16S rRNA 测序); 5.无需拼接的转录组测序; 6.甲基化修饰等表观遗传学研究; 7.多重PCR扩增片段测序。
样品要求1.基因组或PCR产物:双链DNA,未曾反复冻融,未曾暴露在高温环境(>65C)和极端PH环境(< 6或> 9);未经荧光染色或紫外照射(避免EB染色);不包含变性剂(如guanidinium salts 或 phenol)和洗涤剂(如SDS或Triton-X100);不包含不溶解的物质;不包含蛋白、RNA、糖类等污染;不包含来自原始样本的污染物(如heme, humic acid, polypheno等);OD260/OD280范围在1.8 - 2.0,OD260/OD230 约为2.0; 2.基因组DNA总量>5ug,浓度>50ng/ul;PCR产物总量>500ng; 3.制备好的文库:2100检测图谱和Qubit浓度定量结果; 4.损伤较严重样品需提前说明,并与仪器操作人员联系; 5.病毒、致病微生物等危险性样本恕不接收。
仪器说明PacBio RS II测序系统,是基于单分子实时(Single Molecule Real Time, SMRT)DNA测序技术和纳米微孔应用的第三代测序平台。它能带来测序行业最高的一致准确性和最长的读长,让科学家能够快速经济地完成基因组组装,揭示并了解表观基因组,以及鉴定基因组变异,是基因组从头测序和全长转录组测序的最佳选择。上海交通大学2015年引进了华东地区第二台PacBio RS II第三代测序仪,力争提供更全面的基因组测序服务,助力基因组学研究。该仪器由分析测试中心生命科学室管理运行。


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